Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
POLR3EQ9NVU0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
POLR3EQ9NVU0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
POLR3EQ9NVU0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
POLR3EQ9NVU0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
POLR3EQ9NVU0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR3EQ9NVU0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR3EQ9NVU0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
POLR3EQ9NVU0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR3EQ9NVU0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR3EQ9NVU0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
POLR3EQ9NVU0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLR3EQ9NVU0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
POLR3EQ9NVU0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR3EQ9NVU0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR3EQ9NVU0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR3EQ9NVU0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR3EQ9NVU0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
POLR3EQ9NVU0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR3EQ9NVU0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR3EQ9NVU0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
POLR3EQ9NVU0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
POLR3EQ9NVU0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms