Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV29

TMEM100, Transmembrane protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM100Q9NV29 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM100Q9NV29 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM100Q9NV29 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM100Q9NV29 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM100Q9NV29 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM100Q9NV29 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM100Q9NV29 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM100Q9NV29 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM100Q9NV29 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM100Q9NV29 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM100Q9NV29 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM100Q9NV29 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM100Q9NV29 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM100Q9NV29 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM100Q9NV29 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM100Q9NV29 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM100Q9NV29 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM100Q9NV29 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM100Q9NV29 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM100Q9NV29 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM100Q9NV29 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM100Q9NV29 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms