Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GINM1Q9NU53 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GINM1Q9NU53 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
GINM1Q9NU53 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GINM1Q9NU53 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GINM1Q9NU53 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GINM1Q9NU53 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30■■■□□ 2.39
GINM1Q9NU53 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GINM1Q9NU53 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GINM1Q9NU53 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
GINM1Q9NU53 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GINM1Q9NU53 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GINM1Q9NU53 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GINM1Q9NU53 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GINM1Q9NU53 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GINM1Q9NU53 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GINM1Q9NU53 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GINM1Q9NU53 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
GINM1Q9NU53 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms