Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PKDREJQ9NTG1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PKDREJQ9NTG1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PKDREJQ9NTG1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PKDREJQ9NTG1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PKDREJQ9NTG1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms