Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3GQ9NS98 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3GQ9NS98 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEMA3GQ9NS98 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3GQ9NS98 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEMA3GQ9NS98 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3GQ9NS98 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3GQ9NS98 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEMA3GQ9NS98 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEMA3GQ9NS98 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SEMA3GQ9NS98 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA3GQ9NS98 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEMA3GQ9NS98 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3GQ9NS98 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3GQ9NS98 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA3GQ9NS98 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3GQ9NS98 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3GQ9NS98 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA3GQ9NS98 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3GQ9NS98 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA3GQ9NS98 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms