Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GKN1Q9NS71 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GKN1Q9NS71 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GKN1Q9NS71 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GKN1Q9NS71 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GKN1Q9NS71 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GKN1Q9NS71 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GKN1Q9NS71 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GKN1Q9NS71 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GKN1Q9NS71 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GKN1Q9NS71 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GKN1Q9NS71 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GKN1Q9NS71 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GKN1Q9NS71 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GKN1Q9NS71 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GKN1Q9NS71 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GKN1Q9NS71 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GKN1Q9NS71 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GKN1Q9NS71 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GKN1Q9NS71 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GKN1Q9NS71 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GKN1Q9NS71 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GKN1Q9NS71 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GKN1Q9NS71 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GKN1Q9NS71 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GKN1Q9NS71 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GKN1Q9NS71 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GKN1Q9NS71 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GKN1Q9NS71 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GKN1Q9NS71 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GKN1Q9NS71 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GKN1Q9NS71 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GKN1Q9NS71 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GKN1Q9NS71 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GKN1Q9NS71 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GKN1Q9NS71 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GKN1Q9NS71 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms