Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
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