Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
LTBP3Q9NS15 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC31.76■■■□□ 2.68
LTBP3Q9NS15 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
LTBP3Q9NS15 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
LTBP3Q9NS15 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
LTBP3Q9NS15 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
LTBP3Q9NS15 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LTBP3Q9NS15 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms