Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS45Q9NRW7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VPS45Q9NRW7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS45Q9NRW7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS45Q9NRW7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS45Q9NRW7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VPS45Q9NRW7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS45Q9NRW7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VPS45Q9NRW7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS45Q9NRW7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS45Q9NRW7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VPS45Q9NRW7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS45Q9NRW7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS45Q9NRW7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS45Q9NRW7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VPS45Q9NRW7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VPS45Q9NRW7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VPS45Q9NRW7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VPS45Q9NRW7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VPS45Q9NRW7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VPS45Q9NRW7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS45Q9NRW7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS45Q9NRW7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS45Q9NRW7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS45Q9NRW7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VPS45Q9NRW7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS45Q9NRW7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS45Q9NRW7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VPS45Q9NRW7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
VPS45Q9NRW7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VPS45Q9NRW7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms