Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAB6BQ9NRW1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB6BQ9NRW1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB6BQ9NRW1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB6BQ9NRW1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAB6BQ9NRW1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB6BQ9NRW1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB6BQ9NRW1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB6BQ9NRW1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB6BQ9NRW1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RAB6BQ9NRW1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RAB6BQ9NRW1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB6BQ9NRW1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB6BQ9NRW1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RAB6BQ9NRW1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB6BQ9NRW1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms