Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
TULP4Q9NRJ4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TULP4Q9NRJ4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TULP4Q9NRJ4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TULP4Q9NRJ4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
TULP4Q9NRJ4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TULP4Q9NRJ4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TULP4Q9NRJ4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
TULP4Q9NRJ4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
TULP4Q9NRJ4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TULP4Q9NRJ4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
TULP4Q9NRJ4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
TULP4Q9NRJ4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TULP4Q9NRJ4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
TULP4Q9NRJ4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
TULP4Q9NRJ4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TULP4Q9NRJ4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
TULP4Q9NRJ4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TULP4Q9NRJ4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
TULP4Q9NRJ4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TULP4Q9NRJ4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TULP4Q9NRJ4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
TULP4Q9NRJ4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TULP4Q9NRJ4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TULP4Q9NRJ4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TULP4Q9NRJ4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
TULP4Q9NRJ4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TULP4Q9NRJ4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TULP4Q9NRJ4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TULP4Q9NRJ4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
TULP4Q9NRJ4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TULP4Q9NRJ4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
TULP4Q9NRJ4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TULP4Q9NRJ4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TULP4Q9NRJ4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TULP4Q9NRJ4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
TULP4Q9NRJ4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TULP4Q9NRJ4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
TULP4Q9NRJ4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
TULP4Q9NRJ4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TULP4Q9NRJ4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
TULP4Q9NRJ4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
TULP4Q9NRJ4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TULP4Q9NRJ4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TULP4Q9NRJ4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TULP4Q9NRJ4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TULP4Q9NRJ4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
TULP4Q9NRJ4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
TULP4Q9NRJ4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TULP4Q9NRJ4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TULP4Q9NRJ4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
TULP4Q9NRJ4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TULP4Q9NRJ4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TULP4Q9NRJ4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
TULP4Q9NRJ4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
TULP4Q9NRJ4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
TULP4Q9NRJ4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TULP4Q9NRJ4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TULP4Q9NRJ4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms