Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLE3Q9NRF9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
POLE3Q9NRF9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
POLE3Q9NRF9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
POLE3Q9NRF9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms