Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEPEQ9NQ76 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEPEQ9NQ76 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEPEQ9NQ76 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MEPEQ9NQ76 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MEPEQ9NQ76 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MEPEQ9NQ76 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MEPEQ9NQ76 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEPEQ9NQ76 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEPEQ9NQ76 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEPEQ9NQ76 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MEPEQ9NQ76 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MEPEQ9NQ76 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEPEQ9NQ76 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEPEQ9NQ76 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEPEQ9NQ76 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MEPEQ9NQ76 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MEPEQ9NQ76 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms