Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP99

TREM1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREM1Q9NP99 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TREM1Q9NP99 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TREM1Q9NP99 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TREM1Q9NP99 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TREM1Q9NP99 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TREM1Q9NP99 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TREM1Q9NP99 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TREM1Q9NP99 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TREM1Q9NP99 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TREM1Q9NP99 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TREM1Q9NP99 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms