Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN6

GP6, Platelet glycoprotein VI, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP6Q9HCN6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GP6Q9HCN6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GP6Q9HCN6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GP6Q9HCN6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GP6Q9HCN6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms