Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG4Q9H9E3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
COG4Q9H9E3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
COG4Q9H9E3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG4Q9H9E3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG4Q9H9E3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
COG4Q9H9E3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
COG4Q9H9E3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
COG4Q9H9E3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG4Q9H9E3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG4Q9H9E3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COG4Q9H9E3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG4Q9H9E3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COG4Q9H9E3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COG4Q9H9E3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG4Q9H9E3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COG4Q9H9E3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG4Q9H9E3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COG4Q9H9E3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG4Q9H9E3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COG4Q9H9E3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
COG4Q9H9E3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
COG4Q9H9E3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms