Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SOX17Q9H6I2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOX17Q9H6I2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SOX17Q9H6I2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SOX17Q9H6I2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SOX17Q9H6I2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms