Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRN3Q9H3W5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRN3Q9H3W5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRN3Q9H3W5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRN3Q9H3W5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRN3Q9H3W5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRN3Q9H3W5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRN3Q9H3W5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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