Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CTDSP1Q9GZU7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CTDSP1Q9GZU7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CTDSP1Q9GZU7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
CTDSP1Q9GZU7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms