Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YIPF3Q9GZM5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YIPF3Q9GZM5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
YIPF3Q9GZM5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF3Q9GZM5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
YIPF3Q9GZM5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
YIPF3Q9GZM5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
YIPF3Q9GZM5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YIPF3Q9GZM5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
YIPF3Q9GZM5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms