Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.559e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.539e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.399e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.229e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.229e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.099e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 NUDT1-207ENST00000454650 822 ntTSL 221.75■■□□□ 1.079e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 TFG-207ENST00000487505 913 ntTSL 320.89■□□□□ 0.939e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.879e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 CYHR1-206ENST00000526887 1012 ntTSL 319.84■□□□□ 0.779e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 D2HGDH-206ENST00000436747 4549 ntTSL 1 (best)19.55■□□□□ 0.729e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 TFG-203ENST00000463568 723 ntTSL 319.3■□□□□ 0.689e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.419e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.379e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.249e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.249e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.219e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.219e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 NUDT1-208ENST00000471348 263 ntTSL 316.17■□□□□ 0.189e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.019e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.029e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 TFG-204ENST00000476228 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.799e-7■■■■■ 29.5
FTOQ9C0B1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.189e-18■■■■■ 29.4
FTOQ9C0B1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.499e-18■■■■■ 29.4
FTOQ9C0B1 DHFR-205ENST00000511032 1474 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.469e-18■■■■■ 29.4
FTOQ9C0B1 DHFR-206ENST00000513048 994 ntTSL 1 (best)10.76□□□□□ -0.699e-18■■■■■ 29.4
FTOQ9C0B1 DHFR-202ENST00000504396 1447 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.699e-18■■■■■ 29.4
FTOQ9C0B1 DHFR-204ENST00000508282 545 ntTSL 34.59□□□□□ -1.679e-18■■■■■ 29.4
FTOQ9C0B1 DHFR-207ENST00000513314 582 ntTSL 33.64□□□□□ -1.839e-18■■■■■ 29.4
FTOQ9C0B1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.943e-16■■■■■ 29.3
FTOQ9C0B1 RNASET2-204ENST00000421787 1924 ntTSL 223.92■■□□□ 1.423e-16■■■■■ 29.3
FTOQ9C0B1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.263e-16■■■■■ 29.3
FTOQ9C0B1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.263e-16■■■■■ 29.3
FTOQ9C0B1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.013e-16■■■■■ 29.3
FTOQ9C0B1 RNASET2-201ENST00000028008 1220 ntTSL 520.76■□□□□ 0.913e-16■■■■■ 29.3
FTOQ9C0B1 RNASET2-207ENST00000478180 963 ntTSL 520.45■□□□□ 0.863e-16■■■■■ 29.3
FTOQ9C0B1 RNASET2-202ENST00000358165 2445 ntTSL 219.44■□□□□ 0.73e-16■■■■■ 29.3
FTOQ9C0B1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.633e-16■■■■■ 29.3
FTOQ9C0B1 SF1-219ENST00000496969 455 ntTSL 39.64□□□□□ -0.873e-6■■■■■ 29.2
FTOQ9C0B1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.681e-8■■■■■ 29
FTOQ9C0B1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.573e-6■■■■■ 29
FTOQ9C0B1 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.513e-6■■■■■ 29
FTOQ9C0B1 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.413e-6■■■■■ 29
FTOQ9C0B1 TNKS-201ENST00000310430 9620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 28.9
FTOQ9C0B1 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 28.9
FTOQ9C0B1 TNKS-203ENST00000517770 574 ntTSL 46.21□□□□□ -1.421e-6■■■■■ 28.9
FTOQ9C0B1 RANBP1-207ENST00000423859 832 ntTSL 320.84■□□□□ 0.931e-8■■■■■ 28.7
FTOQ9C0B1 RANBP1-205ENST00000418705 932 ntTSL 319.07■□□□□ 0.641e-8■■■■■ 28.7
FTOQ9C0B1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.234e-7■■■■■ 28.7
FTOQ9C0B1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.4■■□□□ 1.184e-7■■■■■ 28.7
FTOQ9C0B1 AL390719.1-206ENST00000451054 565 ntTSL 214.02□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 28.7
FTOQ9C0B1 AL390719.1-203ENST00000456409 750 ntTSL 213.23□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 28.7
FTOQ9C0B1 AL390719.1-205ENST00000433695 540 ntTSL 213.13□□□□□ -0.314e-7■■■■■ 28.7
FTOQ9C0B1 AL390719.1-202ENST00000394517 397 ntTSL 511.21□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 28.7
FTOQ9C0B1 GPAT4-205ENST00000520223 1101 ntTSL 222.5■■□□□ 1.195e-8■■■■■ 28.6
FTOQ9C0B1 GPAT4-203ENST00000519853 768 ntTSL 516.92■□□□□ 0.35e-8■■■■■ 28.6
FTOQ9C0B1 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.075e-8■■■■■ 28.6
FTOQ9C0B1 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.881e-8■■■■■ 28.5
FTOQ9C0B1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.691e-8■■■■■ 28.5
FTOQ9C0B1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.691e-8■■■■■ 28.5
FTOQ9C0B1 STIM1-209ENST00000527651 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.124e-12■■■■■ 28.5
FTOQ9C0B1 KMT5B-211ENST00000458496 556 ntTSL 429.26■■■□□ 2.274e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 KMT5B-210ENST00000453170 594 ntTSL 528.7■■■□□ 2.184e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 SSBP2-203ENST00000504174 632 ntTSL 526.84■■□□□ 1.894e-11■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 KMT5B-207ENST00000427752 2475 ntTSL 226.59■■□□□ 1.854e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.314e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 PISD-215ENST00000479851 655 ntTSL 323.23■■□□□ 1.314e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.214e-11■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.134e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.074e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.064e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 PISD-213ENST00000474017 1760 ntTSL 520.59■□□□□ 0.894e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 SSBP2-208ENST00000507655 845 ntTSL 520.37■□□□□ 0.854e-11■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 MED16-208ENST00000592373 927 ntTSL 320.3■□□□□ 0.844e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.814e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 IDH3B-209ENST00000488299 1620 ntTSL 219.8■□□□□ 0.764e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.664e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 PISD-212ENST00000473770 2378 ntTSL 519.14■□□□□ 0.654e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 IDH3B-210ENST00000491065 823 ntTSL 219.1■□□□□ 0.654e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 SSBP2-207ENST00000507472 582 ntTSL 318.38■□□□□ 0.534e-11■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.511e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 IDH3B-203ENST00000462967 959 ntTSL 218.05■□□□□ 0.484e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.484e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 PISD-205ENST00000429683 609 ntTSL 317.71■□□□□ 0.434e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 PISD-206ENST00000431201 460 ntTSL 417.71■□□□□ 0.434e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 PISD-217ENST00000491342 692 ntTSL 517.23■□□□□ 0.354e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.76■□□□□ 0.274e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.254e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 RXRA-203ENST00000484822 5215 ntTSL 216.54■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 PISD-211ENST00000460723 2534 ntTSL 1 (best)16.47■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.164e-11■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 PISD-216ENST00000486675 837 ntTSL 316.05■□□□□ 0.164e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 KMT5B-212ENST00000466295 638 ntTSL 215.86■□□□□ 0.134e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 SSBP2-215ENST00000512098 566 ntTSL 515.49■□□□□ 0.074e-11■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.044e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 LAMTOR2-206ENST00000489664 868 ntTSL 214.09□□□□□ -0.154e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 PISD-208ENST00000437808 2264 ntTSL 514.06□□□□□ -0.164e-6■■■■■ 28.4
FTOQ9C0B1 LAMTOR2-203ENST00000368305 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.174e-6■■■■■ 28.4
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