Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD6

MRPL1, 39S ribosomal protein L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL1Q9BYD6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MRPL1Q9BYD6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MRPL1Q9BYD6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL1Q9BYD6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL1Q9BYD6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL1Q9BYD6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms