Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A9Q9BXP2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC12A9Q9BXP2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A9Q9BXP2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A9Q9BXP2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A9Q9BXP2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A9Q9BXP2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC12A9Q9BXP2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC12A9Q9BXP2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A9Q9BXP2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC12A9Q9BXP2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A9Q9BXP2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A9Q9BXP2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC12A9Q9BXP2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A9Q9BXP2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC12A9Q9BXP2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A9Q9BXP2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A9Q9BXP2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC12A9Q9BXP2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC12A9Q9BXP2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC12A9Q9BXP2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC12A9Q9BXP2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms