Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP8Q9BV40 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VAMP8Q9BV40 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAMP8Q9BV40 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP8Q9BV40 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123 ms