Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COPS4Q9BT78 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS4Q9BT78 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS4Q9BT78 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPS4Q9BT78 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COPS4Q9BT78 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms