Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM246Q9BRR3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMEM246Q9BRR3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM246Q9BRR3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM246Q9BRR3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms