Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SDF4Q9BRK5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SDF4Q9BRK5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SDF4Q9BRK5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SDF4Q9BRK5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SDF4Q9BRK5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SDF4Q9BRK5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SDF4Q9BRK5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SDF4Q9BRK5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SDF4Q9BRK5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SDF4Q9BRK5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SDF4Q9BRK5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SDF4Q9BRK5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SDF4Q9BRK5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SDF4Q9BRK5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SDF4Q9BRK5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SDF4Q9BRK5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SDF4Q9BRK5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SDF4Q9BRK5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SDF4Q9BRK5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SDF4Q9BRK5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SDF4Q9BRK5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SDF4Q9BRK5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SDF4Q9BRK5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SDF4Q9BRK5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SDF4Q9BRK5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SDF4Q9BRK5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SDF4Q9BRK5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SDF4Q9BRK5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SDF4Q9BRK5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SDF4Q9BRK5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SDF4Q9BRK5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SDF4Q9BRK5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SDF4Q9BRK5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SDF4Q9BRK5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SDF4Q9BRK5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SDF4Q9BRK5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SDF4Q9BRK5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SDF4Q9BRK5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SDF4Q9BRK5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SDF4Q9BRK5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SDF4Q9BRK5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SDF4Q9BRK5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SDF4Q9BRK5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SDF4Q9BRK5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SDF4Q9BRK5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SDF4Q9BRK5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SDF4Q9BRK5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SDF4Q9BRK5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SDF4Q9BRK5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SDF4Q9BRK5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SDF4Q9BRK5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms