Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ZSWIM1Q9BR11 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ZSWIM1Q9BR11 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
ZSWIM1Q9BR11 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZSWIM1Q9BR11 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZSWIM1Q9BR11 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZSWIM1Q9BR11 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZSWIM1Q9BR11 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZSWIM1Q9BR11 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZSWIM1Q9BR11 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZSWIM1Q9BR11 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZSWIM1Q9BR11 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZSWIM1Q9BR11 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZSWIM1Q9BR11 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZSWIM1Q9BR11 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZSWIM1Q9BR11 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZSWIM1Q9BR11 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZSWIM1Q9BR11 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ZSWIM1Q9BR11 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZSWIM1Q9BR11 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms