Protein–RNA interactions for Protein: Q99996

AKAP9, A-kinase anchor protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 3,911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9Q99996 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AKAP9Q99996 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AKAP9Q99996 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AKAP9Q99996 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
AKAP9Q99996 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AKAP9Q99996 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AKAP9Q99996 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
AKAP9Q99996 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
AKAP9Q99996 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
AKAP9Q99996 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms