Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CITED2Q99967 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CITED2Q99967 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CITED2Q99967 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CITED2Q99967 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms