Protein–RNA interactions for Protein: Q99895

CTRC, Chymotrypsin-C, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRCQ99895 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTRCQ99895 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTRCQ99895 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTRCQ99895 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTRCQ99895 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTRCQ99895 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTRCQ99895 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTRCQ99895 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CTRCQ99895 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CTRCQ99895 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CTRCQ99895 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CTRCQ99895 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTRCQ99895 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTRCQ99895 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTRCQ99895 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTRCQ99895 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTRCQ99895 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTRCQ99895 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTRCQ99895 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTRCQ99895 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTRCQ99895 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTRCQ99895 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTRCQ99895 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTRCQ99895 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTRCQ99895 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTRCQ99895 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTRCQ99895 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTRCQ99895 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTRCQ99895 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CTRCQ99895 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTRCQ99895 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms