Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
MEIS3Q99687 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
MEIS3Q99687 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
MEIS3Q99687 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
MEIS3Q99687 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
MEIS3Q99687 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
MEIS3Q99687 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MEIS3Q99687 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MEIS3Q99687 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MEIS3Q99687 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.77
MEIS3Q99687 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
MEIS3Q99687 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
MEIS3Q99687 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MEIS3Q99687 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms