Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
RGPD5Q99666 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RGPD5Q99666 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RGPD5Q99666 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RGPD5Q99666 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RGPD5Q99666 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RGPD5Q99666 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RGPD5Q99666 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
RGPD5Q99666 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RGPD5Q99666 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
RGPD5Q99666 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RGPD5Q99666 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RGPD5Q99666 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
RGPD5Q99666 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
RGPD5Q99666 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
RGPD5Q99666 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RGPD5Q99666 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RGPD5Q99666 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RGPD5Q99666 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RGPD5Q99666 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RGPD5Q99666 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RGPD5Q99666 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RGPD5Q99666 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
RGPD5Q99666 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RGPD5Q99666 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RGPD5Q99666 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
RGPD5Q99666 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RGPD5Q99666 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RGPD5Q99666 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
RGPD5Q99666 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
RGPD5Q99666 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RGPD5Q99666 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RGPD5Q99666 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RGPD5Q99666 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
RGPD5Q99666 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RGPD5Q99666 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RGPD5Q99666 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
RGPD5Q99666 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RGPD5Q99666 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RGPD5Q99666 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RGPD5Q99666 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
RGPD5Q99666 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RGPD5Q99666 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RGPD5Q99666 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
RGPD5Q99666 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RGPD5Q99666 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RGPD5Q99666 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RGPD5Q99666 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RGPD5Q99666 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RGPD5Q99666 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RGPD5Q99666 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
RGPD5Q99666 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
RGPD5Q99666 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
RGPD5Q99666 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RGPD5Q99666 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
RGPD5Q99666 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
RGPD5Q99666 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
RGPD5Q99666 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
RGPD5Q99666 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
RGPD5Q99666 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RGPD5Q99666 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RGPD5Q99666 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RGPD5Q99666 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms