Protein–RNA interactions for Protein: Q99618

CDCA3, Cell division cycle-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA3Q99618 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA3Q99618 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA3Q99618 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA3Q99618 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDCA3Q99618 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA3Q99618 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA3Q99618 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA3Q99618 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDCA3Q99618 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDCA3Q99618 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA3Q99618 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CDCA3Q99618 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA3Q99618 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA3Q99618 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDCA3Q99618 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA3Q99618 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDCA3Q99618 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDCA3Q99618 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA3Q99618 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA3Q99618 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA3Q99618 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDCA3Q99618 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CDCA3Q99618 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDCA3Q99618 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
CDCA3Q99618 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CDCA3Q99618 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDCA3Q99618 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDCA3Q99618 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDCA3Q99618 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms