Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UHRF1Q96T88 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UHRF1Q96T88 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UHRF1Q96T88 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UHRF1Q96T88 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UHRF1Q96T88 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UHRF1Q96T88 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UHRF1Q96T88 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UHRF1Q96T88 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UHRF1Q96T88 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UHRF1Q96T88 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UHRF1Q96T88 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
UHRF1Q96T88 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UHRF1Q96T88 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UHRF1Q96T88 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UHRF1Q96T88 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UHRF1Q96T88 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UHRF1Q96T88 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UHRF1Q96T88 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UHRF1Q96T88 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UHRF1Q96T88 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UHRF1Q96T88 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UHRF1Q96T88 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UHRF1Q96T88 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UHRF1Q96T88 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UHRF1Q96T88 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UHRF1Q96T88 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UHRF1Q96T88 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UHRF1Q96T88 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UHRF1Q96T88 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UHRF1Q96T88 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UHRF1Q96T88 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UHRF1Q96T88 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UHRF1Q96T88 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
UHRF1Q96T88 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UHRF1Q96T88 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
UHRF1Q96T88 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UHRF1Q96T88 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UHRF1Q96T88 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UHRF1Q96T88 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms