Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAB3IPQ96QF0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RAB3IPQ96QF0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB3IPQ96QF0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAB3IPQ96QF0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAB3IPQ96QF0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB3IPQ96QF0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms