Protein–RNA interactions for Protein: Q96QE5

TEFM, Transcription elongation factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TEFMQ96QE5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TEFMQ96QE5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TEFMQ96QE5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TEFMQ96QE5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TEFMQ96QE5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TEFMQ96QE5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms