Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRNT1Q96Q11 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRNT1Q96Q11 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRNT1Q96Q11 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRNT1Q96Q11 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRNT1Q96Q11 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
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