Protein–RNA interactions for Protein: Q96PW8

CSPG4P5, Putative uncharacterized protein KIAA1920, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPG4P5Q96PW8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CSPG4P5Q96PW8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CSPG4P5Q96PW8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CSPG4P5Q96PW8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CSPG4P5Q96PW8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPG4P5Q96PW8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPG4P5Q96PW8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPG4P5Q96PW8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CSPG4P5Q96PW8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSPG4P5Q96PW8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSPG4P5Q96PW8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSPG4P5Q96PW8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CSPG4P5Q96PW8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSPG4P5Q96PW8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CSPG4P5Q96PW8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CSPG4P5Q96PW8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CSPG4P5Q96PW8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSPG4P5Q96PW8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSPG4P5Q96PW8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CSPG4P5Q96PW8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CSPG4P5Q96PW8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSPG4P5Q96PW8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSPG4P5Q96PW8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSPG4P5Q96PW8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSPG4P5Q96PW8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CSPG4P5Q96PW8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSPG4P5Q96PW8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSPG4P5Q96PW8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSPG4P5Q96PW8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSPG4P5Q96PW8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CSPG4P5Q96PW8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms