Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ1

FOXN4, Forkhead box protein N4, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN4Q96NZ1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FOXN4Q96NZ1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FOXN4Q96NZ1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXN4Q96NZ1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXN4Q96NZ1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXN4Q96NZ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms