Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TSNARE1Q96NA8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TSNARE1Q96NA8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSNARE1Q96NA8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSNARE1Q96NA8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSNARE1Q96NA8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSNARE1Q96NA8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSNARE1Q96NA8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSNARE1Q96NA8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSNARE1Q96NA8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSNARE1Q96NA8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSNARE1Q96NA8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSNARE1Q96NA8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TSNARE1Q96NA8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSNARE1Q96NA8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSNARE1Q96NA8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSNARE1Q96NA8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSNARE1Q96NA8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSNARE1Q96NA8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms