Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PKNOX2Q96KN3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PKNOX2Q96KN3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKNOX2Q96KN3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKNOX2Q96KN3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKNOX2Q96KN3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKNOX2Q96KN3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKNOX2Q96KN3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKNOX2Q96KN3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKNOX2Q96KN3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKNOX2Q96KN3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKNOX2Q96KN3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKNOX2Q96KN3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKNOX2Q96KN3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKNOX2Q96KN3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKNOX2Q96KN3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKNOX2Q96KN3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKNOX2Q96KN3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKNOX2Q96KN3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKNOX2Q96KN3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKNOX2Q96KN3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKNOX2Q96KN3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKNOX2Q96KN3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKNOX2Q96KN3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKNOX2Q96KN3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PKNOX2Q96KN3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PKNOX2Q96KN3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKNOX2Q96KN3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKNOX2Q96KN3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PKNOX2Q96KN3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms