Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ABCC12Q96J65 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ABCC12Q96J65 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ABCC12Q96J65 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
ABCC12Q96J65 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ABCC12Q96J65 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
ABCC12Q96J65 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ABCC12Q96J65 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms