Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FBXO17Q96EF6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FBXO17Q96EF6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
FBXO17Q96EF6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FBXO17Q96EF6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms