Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN2

VWCE, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCEQ96DN2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VWCEQ96DN2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
VWCEQ96DN2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VWCEQ96DN2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VWCEQ96DN2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
VWCEQ96DN2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
VWCEQ96DN2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
VWCEQ96DN2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
VWCEQ96DN2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VWCEQ96DN2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
VWCEQ96DN2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VWCEQ96DN2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VWCEQ96DN2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWCEQ96DN2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VWCEQ96DN2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
VWCEQ96DN2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWCEQ96DN2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWCEQ96DN2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VWCEQ96DN2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWCEQ96DN2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VWCEQ96DN2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWCEQ96DN2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWCEQ96DN2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
VWCEQ96DN2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWCEQ96DN2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VWCEQ96DN2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
VWCEQ96DN2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VWCEQ96DN2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWCEQ96DN2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWCEQ96DN2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VWCEQ96DN2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
VWCEQ96DN2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWCEQ96DN2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWCEQ96DN2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VWCEQ96DN2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
VWCEQ96DN2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWCEQ96DN2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VWCEQ96DN2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWCEQ96DN2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWCEQ96DN2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VWCEQ96DN2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWCEQ96DN2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWCEQ96DN2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWCEQ96DN2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VWCEQ96DN2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VWCEQ96DN2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
VWCEQ96DN2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
VWCEQ96DN2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWCEQ96DN2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWCEQ96DN2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
VWCEQ96DN2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWCEQ96DN2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWCEQ96DN2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWCEQ96DN2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWCEQ96DN2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VWCEQ96DN2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWCEQ96DN2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWCEQ96DN2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VWCEQ96DN2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
VWCEQ96DN2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWCEQ96DN2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VWCEQ96DN2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWCEQ96DN2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VWCEQ96DN2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
VWCEQ96DN2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VWCEQ96DN2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
VWCEQ96DN2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VWCEQ96DN2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWCEQ96DN2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWCEQ96DN2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VWCEQ96DN2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWCEQ96DN2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWCEQ96DN2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWCEQ96DN2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
VWCEQ96DN2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWCEQ96DN2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWCEQ96DN2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
VWCEQ96DN2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
VWCEQ96DN2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VWCEQ96DN2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms