Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
SHISA4Q96DD7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SHISA4Q96DD7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SHISA4Q96DD7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHISA4Q96DD7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHISA4Q96DD7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHISA4Q96DD7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SHISA4Q96DD7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SHISA4Q96DD7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SHISA4Q96DD7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHISA4Q96DD7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
SHISA4Q96DD7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SHISA4Q96DD7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
SHISA4Q96DD7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SHISA4Q96DD7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHISA4Q96DD7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHISA4Q96DD7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SHISA4Q96DD7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SHISA4Q96DD7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
SHISA4Q96DD7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30■■■□□ 2.39
SHISA4Q96DD7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHISA4Q96DD7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SHISA4Q96DD7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SHISA4Q96DD7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SHISA4Q96DD7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SHISA4Q96DD7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms