Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDCCAG3Q96C92 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SDCCAG3Q96C92 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SDCCAG3Q96C92 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SDCCAG3Q96C92 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SDCCAG3Q96C92 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms