Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ULK4Q96C45 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ULK4Q96C45 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ULK4Q96C45 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ULK4Q96C45 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ULK4Q96C45 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms