Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VTI1AQ96AJ9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VTI1AQ96AJ9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VTI1AQ96AJ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VTI1AQ96AJ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
VTI1AQ96AJ9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
VTI1AQ96AJ9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
VTI1AQ96AJ9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VTI1AQ96AJ9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
VTI1AQ96AJ9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VTI1AQ96AJ9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
VTI1AQ96AJ9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VTI1AQ96AJ9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VTI1AQ96AJ9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VTI1AQ96AJ9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
VTI1AQ96AJ9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VTI1AQ96AJ9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VTI1AQ96AJ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VTI1AQ96AJ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VTI1AQ96AJ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VTI1AQ96AJ9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VTI1AQ96AJ9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
VTI1AQ96AJ9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VTI1AQ96AJ9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VTI1AQ96AJ9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VTI1AQ96AJ9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VTI1AQ96AJ9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VTI1AQ96AJ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
VTI1AQ96AJ9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VTI1AQ96AJ9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VTI1AQ96AJ9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VTI1AQ96AJ9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VTI1AQ96AJ9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VTI1AQ96AJ9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VTI1AQ96AJ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VTI1AQ96AJ9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VTI1AQ96AJ9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VTI1AQ96AJ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VTI1AQ96AJ9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VTI1AQ96AJ9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VTI1AQ96AJ9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
VTI1AQ96AJ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VTI1AQ96AJ9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VTI1AQ96AJ9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VTI1AQ96AJ9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VTI1AQ96AJ9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VTI1AQ96AJ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VTI1AQ96AJ9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VTI1AQ96AJ9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VTI1AQ96AJ9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VTI1AQ96AJ9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VTI1AQ96AJ9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VTI1AQ96AJ9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VTI1AQ96AJ9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VTI1AQ96AJ9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VTI1AQ96AJ9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
VTI1AQ96AJ9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VTI1AQ96AJ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VTI1AQ96AJ9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VTI1AQ96AJ9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VTI1AQ96AJ9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VTI1AQ96AJ9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VTI1AQ96AJ9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VTI1AQ96AJ9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VTI1AQ96AJ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VTI1AQ96AJ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
VTI1AQ96AJ9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
VTI1AQ96AJ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
VTI1AQ96AJ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VTI1AQ96AJ9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
VTI1AQ96AJ9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
VTI1AQ96AJ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
VTI1AQ96AJ9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
VTI1AQ96AJ9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
VTI1AQ96AJ9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
VTI1AQ96AJ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms