Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC102AQ96A19 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC102AQ96A19 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC102AQ96A19 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC102AQ96A19 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC102AQ96A19 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC102AQ96A19 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC102AQ96A19 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC102AQ96A19 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC102AQ96A19 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC102AQ96A19 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC102AQ96A19 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC102AQ96A19 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC102AQ96A19 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC102AQ96A19 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC102AQ96A19 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC102AQ96A19 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC102AQ96A19 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC102AQ96A19 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC102AQ96A19 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC102AQ96A19 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC102AQ96A19 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC102AQ96A19 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC102AQ96A19 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC102AQ96A19 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC102AQ96A19 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC102AQ96A19 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC102AQ96A19 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC102AQ96A19 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC102AQ96A19 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC102AQ96A19 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC102AQ96A19 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC102AQ96A19 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC102AQ96A19 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC102AQ96A19 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
CCDC102AQ96A19 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC102AQ96A19 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
CCDC102AQ96A19 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC102AQ96A19 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC102AQ96A19 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CCDC102AQ96A19 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC102AQ96A19 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CCDC102AQ96A19 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CCDC102AQ96A19 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC102AQ96A19 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC102AQ96A19 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC102AQ96A19 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC102AQ96A19 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC102AQ96A19 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CCDC102AQ96A19 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC102AQ96A19 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CCDC102AQ96A19 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.45
CCDC102AQ96A19 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CCDC102AQ96A19 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms