Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCAMP4Q969E2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCAMP4Q969E2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCAMP4Q969E2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAMP4Q969E2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAMP4Q969E2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAMP4Q969E2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAMP4Q969E2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAMP4Q969E2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCAMP4Q969E2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP4Q969E2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP4Q969E2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP4Q969E2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP4Q969E2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP4Q969E2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP4Q969E2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAMP4Q969E2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAMP4Q969E2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms